Suba nga anhianhi ang Agatete sa Burundi, sa ibabaw sa utlanan sa Rwanda.[1] Nahimutang ni sa amihanang bahin sa nasod, 150 km sa amihanan-sidlakan sa Bujumbura ang ulohan sa nasod. Agatete nga nahimutang sa lanaw sa Lac Rweru. Ang Agatete mao ang bahin sa tubig-saluran sa Nile River.
Ang klima kasarangan. Ang kasarangang giiniton 21 °C. Ang kinainitan nga bulan Agosto, sa 23 °C, ug ang kinabugnawan Abril, sa 16 °C.[2] Ang kasarangang pag-ulan 1,394 milimetro matag tuig. Ang kinabasaan nga bulan Nobiyembre, sa 168 milimetro nga ulan, ug ang kinaugahan Hunyo, sa 58 milimetro.[3]