Baba sa suba ang Kuala Sekong sa Malaysiya.[1] Nahimutang ni sa estado sa Sabah, sa sidlakang bahin sa nasod, 1,800 km sa sidlakan sa Kuala Lumpur ang ulohan sa nasod. 1 metros ibabaw sa dagat kahaboga ang nahimutangan sa Kuala Sekong.[1] Kuala Sekong nidagayday paingon ngadto sa Dagat Sulu.
Ang klima tropikal nga kasalupan. Ang kasarangang giiniton 23 °C. Ang kinainitan nga bulan Marso, sa 24 °C, ug ang kinabugnawan Enero, sa 20 °C.[2] Ang kasarangang pag-ulan 3,035 milimetro matag tuig. Ang kinabasaan nga bulan Enero, sa 531 milimetro nga ulan, ug ang kinaugahan Hunyo, sa 141 milimetro.[3]