Piliw ang Mifune Se sa Hapon.[1] Nahimutang ni sa prepektura sa Kumamoto-ken, sa habagatan-kasadpang bahin sa nasod, 900 km sa kasadpan sa Tokyo ang ulohan sa nasod. 1 metros ibabaw sa dagat kahaboga ang nahimutangan sa Mifune Se.[1] Kinahabogang dapit sa palibot ang Ō Take, 469 ka metros ni kahaboga ibabaw sa dagat, 4.3 km sa amihanan-sidlakan sa Mifune Se.[saysay 1] Dunay mga 570 ka tawo kada kilometro kwadrado sa palibot sa Mifune Se nga hilabihan populasyon.[2] Ang kinadul-ang mas dakong lungsod mao ang Yatsushiro, 13.8 km sa habagatan sa Mifune Se. Hapit nalukop sa kaumahan ang palibot sa Mifune Se.[3] Sa rehiyon palibot sa Mifune Se, mga estretso, nga bato nga pormasyon, ug kapuloan talagsaon komon.[saysay 2]
Ang klima kasarangan. Ang kasarangang giiniton 16 °C. Ang kinainitan nga bulan Septiyembre, sa 24 °C, ug ang kinabugnawan Enero, sa 6 °C.[4] Ang kasarangang pag-ulan 2,690 milimetro matag tuig. Ang kinabasaan nga bulan Hunyo, sa 561 milimetro nga ulan, ug ang kinaugahan Enero, sa 58 milimetro.[5]